ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIR319
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGTGCTCCC miRNA* GAGCGTCCTTCAGTCCACTC mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GATGGAAGAGAGCGTCCTTCAGTCCACTCAGGGGCGGTGCTAGGGTCGAATTAGCTGCCGACTCATTCACCCACATGCCAAGCAAACGGCCATGGAAACC
AGCTTTGCAGATGAGTGAATGAAGCGGGAGGTAAAAGCTTCGATCTCGCACCGTCTTTGCTTGGACTGAAGGGTGCTCCCTCCTCC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR319b: 5e-103 PMRD zma-miR319b: 5e-103 microPC miR319: 2e-44 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-100 | most similar mature miRNAs |
Identical with: zma-MIR319b from miRBase (MNEST042781) |
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