ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIR812
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGAATAAGACGACTGGTCAA miRNA* GAGCACTCGTTTTATTCAAAA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TATTAAGTGTTACTCCCTCCGTCCCAGTTTTTAATTCATTTGACTTTTTCAATCCTAACTTTGAGCACTCGTTTTATTCAAAACATTTGTAAAAAACAAA
AAAATCATTGTGATTTTGTTTATTTCAAATGTACTTTACATATGTCTTTTTTTCCCCATTTTTTCATGATTTTTTTGAATAAGACGACTGGTCAAAGTCG
AGGTTGAAAAAGTCAAACTAATTATAATTTGAAGCGGAGGGAGTATAATAAATG
dot-bracket secondary structure
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR818e: 0.00001 PMRD osa-miR818e: 0.00001 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR806: 0.00006 | most similar mature miRNAs |
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