ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIR2504
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGACCGAGTTTATAGAAAAA miRNA* TTTCTAAAAGCTTGATCAAAA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
CGTCTCAAATAATAGTTTACTTTAGCTTTGTGCCTCTGTCCTAAGTCAAACTTGTTTAACTTTGACCGAGTTTATAGAAAAATGCATCAACATCTAGAAT
ACCAAATTCTTTTCATTAATTTCTTCATGAGACATGTCTTGATAGTGAATTTGATTTAACTTCTAGATACTAATGTATTTTTCTAAAAGCTTGATCAAAA
CTAGAGAAGTTTGACATAGGACAAAACTAAAGTAAACTATAATT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ssp-MIR437a: 2e-19 PMRD sbi-miR437v: 9e-16 microPC miR437: 2e-19 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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