ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAAGTCATTCTAGCATTTCCC miRNA* GAGATGCTAAAATGACTTACA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TACTGAACTGTACTCCCTCCATTTCACAATTTAAGTCATTCTAGCATTTCCCACATTCATATTGAAGTTGAGGAATGTANACATATATATCTATCTAGAT
TCATTAACATCAATATGAATGTGGGAGATGCTAAAATGACTTACATTGTGGAATGGAGGAAGTATGTAGTTAG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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TCATTAACATCAATATGAATGTGGGAGATGCTAAAATGACTTACATTGTGGAATGGAGGAAGTATGTAGTTAG
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR808: 2e-52 PMRD osa-miR808: 2e-52 microPC miR809: 3e-21 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 2e-50 | most similar mature miRNAs |
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