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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST003917
species:
Oryza sativa
miRNA family:
MIR1525
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa
Oryza
Oryzeae
Ehrhartoideae
BEP clade
Poaceae
Poales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
AGGGTTAATTAAGTGTTTAAT
miRNA*
TGAAGATATGCTTGACCTTGA
mismatches:
5
bulges:
0
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pre-miRNA
TTGCAGACCAAATCGATAAACCGAAGAACAA
AGGGTTAATTAAGTGTTTAAT
TATGTACTTCGTATTTCTCTGCCCAAAAAAGCTTTACTGTTTGGAGTG
CCGTGTTGTAAATTAGAAAATGTGTCACAAAACTTTGCTTACACTAATATTTATAGTGGCCAATGTTCATTCTACAATAATAGTTTGGTAGTAATACCGC
TTACTACTTCTTTCTTTTTATTTGCACAGTGCCACTGACTACATAACCACTATGAATCAGGTGTACTGATCCTCCTCAATAAGTTGGAGCAGGAGTTATC
ATGGCAAGCCTTGCTGATTCTTTCTTAGCAGATCTTGATGAACTGTCAGACAATGAAGCCTATCCTGAAGAAAAAATGCTGAGGCAGTGGGTATGGATGA
TGATGGCGG
TGAAGATATGCTTGACCTTGA
GTCTCTTAATTTGATGATCTTGACAGTG
dot-bracket secondary structure
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