ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGTGGGACGGAGGGAGTACTA miRNA* GAACTCCATCCGTCCCATAAT mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAGAATTGAATGGAACTCCATCCGTCCCATAATATAAGAGATTTTAAGTTTTCATTTGCAAATATTTGATCACTCGTTTTATTAAAAAAATTTTGAAATT
ATTATTTATTTTATTATCTATAGTACTTTAAGCATAACTTTTTGTTTTTTATATTTGCGAAAAAAAATTAAATAAGACGAGTGGTCAAACGTTGTAAGCA
AAAACTCTCAAAATCTCTTATATTGTGGGACGGAGGGAGTACTATGCTAGTTA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR818e: 0.0000000002 PMRD osa-miR818e: 0.0000000002 microPC miR818: 0.0000002 | UniProt no hits RFAM MIR806: 1e-21 | most similar mature miRNAs |
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