ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TACTCCCTCCGTCTCAAAAAA miRNA* TTTTTTGATGGAGCGAGTACA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
ACCACCGCACATACTCCCTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAACCTAGTTTCCGTGTCCATCGTTTAACCGTCCTGTCTTATTTGAAAAATTTGTGAAAAAAT
TTAAAAAGATAAGTCACGCATAAAGTATTAATTATGTTTTATCATCTAACAGCAATGAAAATACTAATTATAAAAAAATTTCATATAAGACGGATAGTCA
AACGTTGGCCACAAAAACATAGGGTTTGTCTTTTTTTTTTTTGATGGAGCGAGTACAGCACCAGT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR812o: 0.00000000000006 PMRD osa-miRf11361-akr: 1e-30 microPC miR812: 1e-18 | UniProt no hits RFAM MIR812: 2e-32 | most similar mature miRNAs |
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