ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GTCTCATAACCTGAAACGGAG miRNA* CTGTTTCAGATTATAAGACGT mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAACTACTTCCTCTGTTTCAGATTATAAGACGTTTTTGACTTTANTTAAAGTCAAACTACTTTATGTTTAACTAAGTTTGTATAAAAATTAGTAACATTT
TCAATCCAAAACAAATTTATTATAAAAATATATTCAATTATTGATTTGATTAAACTAATTTAATATTATAAATATTACTATATTTATCTATAAACTTAGT
CAAACTTTAAACCGTTTAACTTTGACCCAAGTCAAAACGTCTCATAACCTGAAACGGAGGCAGCATTA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.00006 | most similar mature miRNAs |
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