ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTCAAAAGATTCGTCTCGCAA miRNA* GCGAGACGAATCTATTAAGCC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
CACATTTGAAGTATTAAATGTAGACTAATAACAAAACAGATTACAGATTTCGCTTATAAACTGCGAGACGAATCTATTAAGCCTAATTAATTCGTCATTA
GCAAATGTTTACTTGAGCACCACATTGTCAAATCAAGACGTAATTAGACTCAAAAGATTCGTCTCGCAATTTACATGCAAACTGTGCAATTGGTTTTTTT
CGTCCATATTTAATGCTCCATATATGTA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR2124a: 9e-62 PMRD osa-miR442: 5e-51 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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