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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST004054
species:
Oryza sativa
miRNA family:
MIRf905
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa
Oryza
Oryzeae
Ehrhartoideae
BEP clade
Poaceae
Poales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
CCCATGTCACATCGGATGTTT
miRNA*
ACATCCGATGTGACAGGGAC
mismatches:
0
bulges:
1
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pre-miRNA
TAA
CCCATGTCACATCGGATGTTT
GGACGCTAATTTAGAGTATTAAACATGGAGCTAATAAAAAAACTAATTTCATAAATGAGAGGCTAATCCGCCAGAC
GAATTTTTTAAGCCTAATTAATCCATAATTATCAAAAGTTTACTGTAGCATCACAGTTGTCAAAATCATGGCGTAATTAGACTCAAAAGATTCGTCTCGC
GAATTAGTCCAAGCTTATGAAATGGGTTATGTAATTAGTGTATGTTTAATACTCCAAATTAGGGTCCAA
ACATCCGATGTGACAGGGAC
dot-bracket secondary structure
...
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SIMILARITIES
miRBase
osa-MIR445a
:
1e-70
PMRD
osa-miR445a
:
1e-70
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
no hits
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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