ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGTGGGCAATGCTAGAAAGT miRNA* TTTCTACCACACTCACATTC mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
ACTATATTTTCCTCCTTTCGTGCTTCCTTCCCTTTCATATTATAACACTTTCTACCACACTCACATTCATATATATGGTAATGAATCTAAATATATATGT
GTCCCTAGATCCATTAATAACTATATGAATGTGGGCAATGCTAGAAAGTTTTATAATATGAAACGGAGGTAATAATATGAAATGGAGCCAGTAT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR819e: 6e-35 PMRD osa-miR819e: 6e-35 microPC miR446: 0.000000000000003 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 4e-27 | most similar mature miRNAs |
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