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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST004339
species:
Oryza sativa
miRNA family:
MIRf75
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa
Oryza
Oryzeae
Ehrhartoideae
BEP clade
Poaceae
Poales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
CGCGAGACGAATCTATTGAGC
miRNA*
TTAAAAAATTTGTCTTGCAAA
mismatches:
4
bulges:
0
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pre-miRNA
ATGTTTGGATAATAATTATAAATATTAAACGTAGACTATTAATAAAACCCATTCATAATCTTGGACTAATT
CGCGAGACGAATCTATTGAGC
CTAATTAA
TCTATGATTAGCCTATGTGATACTACAATAAACATTCTCTAATTATGGATTAATTAGGC
TTAAAAAATTTGTCTTGCAAA
TTAGTTTTCGTTTATGTAAT
TAGTTTTGTAAGTAGTCTATATTTAATACTCTAAATTAGTATCTAAAT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
osa-MIR445a
:
8e-44
PMRD
osa-miR445a
:
8e-44
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
no hits
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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