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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST004391
species: Oryza sativa
miRNA family: MIR2123
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 GAAAAAGTCAACGGTGTCATC

miRNA*
 TGACGCCGTTGATTTTTTCGT

mismatches: 0
bulges: 0
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pre-miRNA
 CATATATTATACTCCCTCCGTTTTTTAATAGATGACGCCGTTGATTTTTTCGTACATGTTTGACAATTCGTCTTATTCAAAAACATTACATAATTATAAT
TTATTTTATTATGAGTTGTTTTATCACTCATAGTACTTTAAGTGTGATTTATATTTTATAAATTTGCATAAAATTTTTGAATAAGACGAATGGTCAAACA
TGTAAGAAAAAGTCAACGGTGTCATCTATTAAAAAACGGAGGGAGTATAATCTTT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR806h: 6e-17

PMRD oni-miR812: 6e-57

microPC miR1884: 0.000000000000004		UniProt sp|P0C282|SAP18_ORYSJ: 0.0000002

RFAM MIR806: 7e-88		most similar mature miRNAs

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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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