miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Back to search results



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST004392
species: Oryza sativa
miRNA family: MIR806
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG

miRNA*
 TTGTTAACTTTTTAGTACGTGT

mismatches: 1
bulges: 0
View larger
pre-miRNA
 TTTAGCTAATACTCCCTCCGTTTCAAAATATTTGACATTGTTAACTTTTTAGTACGTGTTTGACCATTTGTCTTATTCAAAAAATTAAAGTAATTGTTTA
TTCTTTTTATATCATTTGATTTATTATTAAATATACTTTCATATATATATATATATATAGTTTTACATATTTCACAATTTTTTTTAATAAGATTAATGGT
TAAACATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTTAAATATTTTGAAACGGAGGGAGTATTAATCTA

dot-bracket secondary structure
......((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((((..((((((..((((((
.......((.(((....))).))....)))))))))))).(((((((....))))))).((............))...)))))).)))))))).))))))
))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).....


SIMILARITIES
miRBase osa-MIR806c: 4e-24

PMRD osa-miR806c: 4e-24

microPC miR806: 0.0000000009		UniProt no hits

RFAM MIR806: 3e-28		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record




Liczniki na strone;