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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST004394
species: Oryza sativa
miRNA family: MIR1884
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTTGACGCCGTTGACTTTTTA

miRNA*
 AAAAGTCAACGGTGTTAAATA

mismatches: 0
bulges: 0
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pre-miRNA
 CTGTATATAATACTTCCTCCGTTTCGAAATGTTTGACGCCGTTGACTTTTTAGCACATATTTGACCATTTGTCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTA
ATTCTTTTCTTATCATTTAATTCATTGTTAAATATATTTTTATGTAGGCATATAATTTTACATATTTCACAAAAGTTTTTGAATAAGACGAATGGTCAAA
CATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTTAAATATTTCGAAACGGAGGGAGTAGAACACAAG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR806e: 2e-109

PMRD osa-miR806e: 2e-109

microPC miR806: 1e-70		UniProt no hits

RFAM MIR806: 2e-100		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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