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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST004406
species: Oryza sativa
miRNA family: MIR806
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ATGTGCTAAAAAGTTAACGGT

miRNA*
 CGTTTATTTTTCTAAATATGT

mismatches: 5
bulges: 0
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pre-miRNA
 AAATACTCCATCTATTTCTAAATATTCAATACCGTTTATTTTTCTAAATATGTTTGACCGTTCGTTTTATTTAAAAAAAATTAAGTAATTATTAATTCTT
TTCCTATCATTTGATTCATCGTTAAATATACTAATAAATATACATATAGTTTTATATACTTCTTAAAAGTTTTTAAATAAGACGAACGGTTAAATATGTG
CTAAAAAGTTAACGGTGTCAAATATTTAGAAACGGAGGGAGCGAG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR806h: 3e-40

PMRD osa-miR806h: 3e-40

microPC miR806: 1e-30		UniProt no hits

RFAM MIR806: 6e-116		most similar mature miRNAs

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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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