ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR444
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGCAGTTGCTGCCTCAAGCTT miRNA* GCTAGAGGTGGCAACTGCATA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGATATGCAATTGGGGGCAGCAAGCTAGAGGTGGCAACTGCATAATTTGCAAGAAATTGTTGGCTGAAGATCATACCGATGATATTCTTGCAAGTTATGC
AGTTGCTGCCTCAAGCTTGCTGCCTCCTGTTGCCAAAG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR444a: 2e-70 PMRD tae-miR444: 3e-17 microPC miR444: 0.00000000000003 | UniProt sp|Q6VAM4|MAD23_ORYSJ: 0.00001 RFAM MIR444: 7e-68 | most similar mature miRNAs |
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