ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR809
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGAATGTGAGAAATGCTAGAA miRNA* CTATTATTTCCTATATTCATA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
AACTACTCCATCCGTTTTACAATGTAAGTCATTCTATTATTTCCTATATTCATATTGATGCTAATGAATCTAGACATATATACCTATCTAGATTCATTAG
TATCAATATGAATGTGAGAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGAAAAAATAGT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR809d: 9e-49 PMRD osa-miR809d: 9e-49 microPC miR809: 3e-27 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 1e-57 | most similar mature miRNAs |
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