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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST004573
species: Oryza sativa
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTACATTGTGAAACGGAGGAA

miRNA*
 TCTCCGTTTCACAATATAAGT

mismatches: 2
bulges: 0
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pre-miRNA
 AACCTGTACTCTCTCCGTTTCACAATATAAGTCATTTTAGTATTTCTTACATTTATATTGATGTTAATGAATCTAAACATATATTCATTAACATCAATAT
GAATATGAAAAATGCTAGTATGACTTACATTGTGAAACGGATCACAATATAAGTCATTTTAGTATTTCCCATATTTATATTGATGTTAATGAATCTAAAC
ATATATTCATTAACATCAATATGAATGTGAAAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTAACTGA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR809d: 5e-30

PMRD osa-miR809d: 5e-30

microPC miR809: 1e-18		UniProt no hits

RFAM MIR1122: 1e-43		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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