ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR1127
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AACTACTCCATCCGTCCCAGA miRNA* TGGGACGGAGGGAGTAAATAA mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
ACATAGCCAACAAGTTGTTTAACTACTCCATCCGTCCCAGAATATAAGAAGTTTTAAAGTTGGACACGGTTATTAAAAAAATTGGTAGAAGTAAATGGTA
GAGGGTTGTGATTAGATGAGTAGTGGAGGTAGGTAGAAAAAGTGAATGGTGGAGAGTTGTGATTGGTTGGGAAGAAAATGTTGATCGAGAAGTTGTTATA
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dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR1442: 0.00001 PMRD osa-miRf11705-akr: 0.0000009 microPC miR1439: 0.0002 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.000001 | most similar mature miRNAs |
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