ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG miRNA* GAGCTCCTTTCGGTCCAAAAA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGTGGACGTTGAGCTCCTTTCGGTCCAAAAAGGGGTGTTGCTGTGGGTCGATTGAGCTGCTGGGTCATGGATCCCGTTAGCCTACTCCATGTTCATCATT
CAGCTCGAGATCTGAAAGAAACTACTCCAATTTATACTAATAGTATGTGTGTAGATAGGAAAATGATGGAGTACTCGTTGGGATAGGCTTATGGCTTGCA
TGCCCCAGGAGCTGCATCAACCCTACATGGACCCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCTTTG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR159a: 8e-143 PMRD osa-miR159a: 8e-143 microPC miR319: 0.000003 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-141 | most similar mature miRNAs |
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