ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR446
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TATCAATATGAATGTGGGAAA miRNA* TCTCATATTCATATTAATATT mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TCAGTGTTAAGTGTTACTCCCTCCGTTTCATAATGTAAGTCATTCTAGTATTTCTCATATTCATATTAATATTAATGAATCTAACCATATATATCTAATA
TCAATATGAATGTGGGAAATACTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTAACGAATAAAGGGA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR809d: 3e-24 PMRD osa-miR809d: 3e-24 microPC miR1132: 0.0000000006 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 6e-44 | most similar mature miRNAs |
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