ABOUT THIS RECORDspecies: Sus scrofa
miRNA family: mir-649
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Sus scrofa Sus Suidae Suina Cetartiodactyla Laurasiatheria Eutheria Theria Mammalia Amniota Tetrapoda Sarcopterygii Euteleostomi Teleostomi Gnathostomata Vertebrata Craniata Chordata Deuterostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AAACCTATGTTGTTCAAGGGT miRNA* CCTTGAATAACTCAGGGCTTA mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGTACAACCGACCCTTGAATAACTCAGGGCTTAGGGACACAGCTGAATATTCGGGTGTAATTTATAGCTGGCCCTCCTTACGTGTGCTTCCTCCACCTCC
AGGATTTCGCATCTGTGGAATTTACTACTGAAAAAGATTTGCATATAAGTGGGCCCCGCACAGTTCAAACCTATGTTGTTCAAGGGTCAACTGCAC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM mir-649: 0.0000000008 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
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