ABOUT THIS RECORDspecies: Xenopus tropicalis
miRNA family: miR-1777a
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGGGGCGGAGGGGGGCGGGC miRNA* TCGTTTTTCTTTGCTTCGCTCT mismatches: 0 bulges: 1 |
pre-miRNA
CCTACCTTTGCCCCGGCATTCTCTCTGGCCTGGTTCCTCGGTCGGAGGGTGTTCGTTTTTCTTTGCTTCGCTCTGCACGGGGGGGCGGAGGGGGGCGGGC
GCCTTCTGGCTGAGGAGCCAGGTCGGAGAGAAGGCTGGGACAAAGTATG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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CCTACCTTTGCCCCGGCATTCTCTCTGGCCTGGTTCCTCGGTCGGAGGGTGTTCGTTTTTCTTTGCTTCGCTCTGCACGGGGGGGCGGAGGGGGGCGGGC
GCCTTCTGGCTGAGGAGCCAGGTCGGAGAGAAGGCTGGGACAAAGTATG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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