ABOUT THIS RECORDspecies: Xenopus tropicalis
miRNA family: mir-297
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGTATGTATGCATGTATGTA miRNA* TGTACGCAGCACTGTACAGTA mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
TAGTTTAGCACATGTATGTATGCATGTATGTATGTATAGCTTTACTTATAAGGGCTCTGGCACACGGGGAGATTAGTCGCCGGCGACTAATCTTTCTGTG
TGCCAGAGCCCTAAAGCGCTACTTATGTACGCAGCACTGTACAGTAGAATACAT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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TAGTTTAGCACATGTATGTATGCATGTATGTATGTATAGCTTTACTTATAAGGGCTCTGGCACACGGGGAGATTAGTCGCCGGCGACTAATCTTTCTGTG
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM Clostridiales-1: 0.0001 | most similar mature miRNAs |
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