ABOUT THIS RECORDspecies: Ciona intestinalis
miRNA family: miR-4142
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Ciona intestinalis Ciona Cionidae Phlebobranchia Enterogona Ascidiacea Tunicata Chordata Deuterostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TATCAGCTCATCTGGTATAAA miRNA* TATACCAGATGAACCAAAAA mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
AAATAACATTTTATCAGCTCATCTGGTATAAAAATCGCTAATTTTACTATTAAATTCTGATGGAGTCTTGCCGAGTTACAGACGAAACGTTAAGGTTATG
TTAAAGTTTTTTACACCAAAAAAATTTAAAAAAATGTGTTGTTTACCGAAACATAAAAGTTTTATACCAGATGAACCAAAAAATGTTTAG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase cin-mir-4142: 0.0006 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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