ABOUT THIS RECORDspecies: Ciona intestinalis
miRNA family: miR-4098
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Ciona intestinalis Ciona Cionidae Phlebobranchia Enterogona Ascidiacea Tunicata Chordata Deuterostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCGAAACGTAACAGAGCGATT miRNA* CCGCTATGTTTCGCTTCGGTT mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
GTTTTTCAAATACAGACTACTAATCAACCATCCCTTTTTATAACCAATCAAACCGCTATGTTTCGCTTCGGTTAGTTAGGGGTTAAAGCGACTTGATTGG
TATATATTGCGTGGACGTGCGTCTTATAAAAATACGTTGTCACCGAAACGTAACAGAGCGATTTAATTGGTTAACAGCGGGGATGGATGCGTAATAGTTT
GTAGATATCTGT
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase cin-mir-4098: 0.00000004 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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