ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
miRNA family: MIR2010
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGTGCGCAATAAGATTTTGCT miRNA* AAAAATCTTATTGTATACATG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAAGTGAAGAGAGCAGAGTATCTTGGTCGTACTAATCAATTCATCATATTATGTGCGCAATAAGATTTTGCTATGCTTTCACCGTTGATTCAACCAATTG
ACATCAATGTTGATAAAGGCATGGAAAAATCTTATTGTATACATGATATGGTGATTGATTTCATATGCTGAAGAACCCTTGCATGGCACTGAG
dot-bracket secondary structure
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD tae-miR2010: 8e-59 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
Identical with: tae-miR2010 from PMRD (MNEST054726) |
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