ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
miRNA family: MIR1120
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ACTCCCTCCGTCCCATAATAT miRNA* ATTATGGGACGGGGGGTGTAG mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
CCGGGCATGGACTCCTGCATCTCTAAAACTTCAGCATGGCCTCCAACGCGCGAAGAACGTCGTCGCGGGTAACTATACCTGTTAGCAGTGTTTAGAATAT
CCTGTTAAGCTTGAAAACATAATCCAAACAATAGTTGATGTTAAGGGGATGATACAGATCTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGTTTTTGACATT
ACATTAGTGTAAAAAACGCTCTTATATTATGGGACGGGGGGTGTAGNATAGATNAGTCCTNTNCTGATGNACTANTGNTGGGATCANGTANTCANGCATN
ACAGGATAGTCTAGNCACNGCANACNGGNATAGNGCATCGCGACGACGTANCNTCGCGCGNTGGNGGNCATGCCGNNGNTTTATNAGATGAGGAGNNGAT
GNCN
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase hvu-MIR1120: 0.000000000006 PMRD tae-miR1120: 0.0000000004 microPC miR1439: 7e-21 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 5e-28 | most similar mature miRNAs |
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