ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
miRNA family: MIR1125
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AACCAACGAGACCAACTGCGGCGG miRNA* GCCACATTCGGTCTTGTTGGTTAA mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTCATGTTTGGCCGTAAATTTAACCAACGAGACCAACTGCGGCGGGAACAAAAATTATATCGCTGAATTATATCAAAAATACNAATTCAGTAGCATAGGT
TTTGCTCCCGCCACATTCGGTCTTGTTGGTTAAATTTACGGTCAAA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1125: 1e-69 PMRD tae-miR1125: 7e-74 microPC miR1125: 5e-56 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
Identical with: tae-miR1125 from PMRD (MNEST054700) |
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