ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
miRNA family: MIRf755
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CGTCGAGGAGGAGCTCGAGTG miRNA* CTCCTGCTCCTCGTCGGCCTC mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGTTGACCTGCCGGCGCATGACGTCGAGGAGGAGCTCGAGTGGGTGTCCCGTATCATGGACGACTCGCTCTCCGAGCTGCCCCCGCAGCCGGCGCCGCCC
GCGTCGATGATGGCCTCGTTGGCGCCACGCCCGCCGCAGCACCGGCTACCCCAGCGACACCCGCTACCGCAGCGGCACCCGCAGGATGGAGCGTACCGCG
CTCTGCCGTCCATGTCCGACCCTATGCGGACTCCGACCATATGCGCGCTGTCCACGGAGGCGCTGGTTCCGGTCAAGGCGAAGCGCAGCAAGCGCTCTCG
GGCGTCGGGGTGGTCGCTCTCGGGCCCCGCGCCGGACTCCACCTCGTCCTCGTCGACCACCACCACCTCCTCCTGCTCCTCGTCGGCCTCCTTCTCGCCC
TACTTCCT
dot-bracket secondary structure
............((((...((.(((((.(((((((..(((.(((((..........(((.((((.(((..((((((((((....))))).((((((((((
((((((((((.....)))))))))).(((((((.(((...(((((..(((((.(((....(((((.....)))))....))).))..(((((((...)))
))))((.(((...(((((........)))))...))).....))(((((.........))))).))).)))))....))).(((((.....)))))..))
)))))..)))))).)))).)))))....)))..((((........))))..)))).)))....))))).)))..))))))).))))).)).....)))).
........
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
degradome data
download this record
TGTTGACCTGCCGGCGCATGACGTCGAGGAGGAGCTCGAGTGGGTGTCCCGTATCATGGACGACTCGCTCTCCGAGCTGCCCCCGCAGCCGGCGCCGCCC
GCGTCGATGATGGCCTCGTTGGCGCCACGCCCGCCGCAGCACCGGCTACCCCAGCGACACCCGCTACCGCAGCGGCACCCGCAGGATGGAGCGTACCGCG
CTCTGCCGTCCATGTCCGACCCTATGCGGACTCCGACCATATGCGCGCTGTCCACGGAGGCGCTGGTTCCGGTCAAGGCGAAGCGCAGCAAGCGCTCTCG
GGCGTCGGGGTGGTCGCTCTCGGGCCCCGCGCCGGACTCCACCTCGTCCTCGTCGACCACCACCACCTCCTCCTGCTCCTCGTCGGCCTCCTTCTCGCCC
TACTTCCT
dot-bracket secondary structure
............((((...((.(((((.(((((((..(((.(((((..........(((.((((.(((..((((((((((....))))).((((((((((
((((((((((.....)))))))))).(((((((.(((...(((((..(((((.(((....(((((.....)))))....))).))..(((((((...)))
))))((.(((...(((((........)))))...))).....))(((((.........))))).))).)))))....))).(((((.....)))))..))
)))))..)))))).)))).)))))....)))..((((........))))..)))).)))....))))).)))..))))))).))))).)).....)))).
........
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
degradome data
download this record
