ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGAAGTTTGACTTAAGACAAA miRNA* TGTCTTAAGTCAAACCTTCAA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGACATGCTCCCTCTGTTTATTTTTACTCCGCACATTAGGTTTGTCTTAAGTCAAACCTTCAAAAGTTTGGCCAAGTTTCTGCTAAAAAATACCAACATT
CACAATATCAAATAAATACACTAACATAAATTTGGTCAGACTATGGGAAGTTTGACTTAAGACAAACCTAATATGTGGAGTGAAAAGGAACAGCATGAGT
ACTTC
dot-bracket secondary structure
.....(((((...((((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.(((...(((((((((((((((.((.((...............
.....................)).)).)))))))))))))))...))).))))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))...))))
)....
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
AGACATGCTCCCTCTGTTTATTTTTACTCCGCACATTAGGTTTGTCTTAAGTCAAACCTTCAAAAGTTTGGCCAAGTTTCTGCTAAAAAATACCAACATT
CACAATATCAAATAAATACACTAACATAAATTTGGTCAGACTATGGGAAGTTTGACTTAAGACAAACCTAATATGTGGAGTGAAAAGGAACAGCATGAGT
ACTTC
dot-bracket secondary structure
.....(((((...((((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((((((.(((...(((((((((((((((.((.((...............
.....................)).)).)))))))))))))))...))).))))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))...))))
)....
SIMILARITIES| miRBase bdi-MIR437: 0.0002 PMRD bdi-miR437: 0.0002 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
