ABOUT THIS RECORDspecies: Physcomitrella patens
miRNA family: MIR1023
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Physcomitrella patens Physcomitrella Funariaceae Funariales Funariidae Bryopsida Moss Superclass V Bryophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ACACTCTCTCCATTTCTCTAC miRNA* AGAGAATTGGAGAGAGTGCAT mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGACCACCTTGCAGTTTCATGGCACACTCTCTCCATTTCTCTACCGTTCATGCAGCGGTTGATCGATTGGGTTGCTGGTTGATTGATCGATCGATGGTCA
GGAGTTGGAAGAGAATTGGAGAGAGTGCATTGTGAATTGCGGGGTTGACG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase ppt-MIR1023a: 1e-81 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1023: 2e-80 | most similar mature miRNAs |
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