ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum tuberosum
miRNA family: miR166g
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGATGTTGTTTGGCTCGACA miRNA* TCGGACCAGGCTTCATTCCTC mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
CATTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGA
ATAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTTC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR166m: 1.0E-8 PMRD zma-miR166m: 1.0E-8 microPC miR166: 0.0001 | UniProt no hits RFAM 6mir-166: 2.0E-7 | most similar mature miRNAs |
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