ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum tuberosum
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GTACTCCCTCCGTCCCATTTT miRNA* ATTGGGACAGAGGGAGTATTT mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
CACTCTCCCATGTACTCCCTCCGTCCCATTTTATATGAGGTACTTTAACTCGGCACGGAGTTTAAGAAAGAAGGGAAGACTTTTAAAACTTGTGGTCCAA
AATGAATGATAGAAATTTGTGTGGCTGTAAATCATTTCATTAAGGGTAAAATAGACATTTTATAGTTGAAAAGTTACTTAATATAGAAATGTGTCATTCT
TTTTGGGACTGACTAAAAAGGAAAGTGAGTCATATAAATTGGGACAGAGGGAGTATTTGGTATTCC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR812h: 0.00001 PMRD osa-miR812h: 0.00001 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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