ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum tuberosum
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTACTCCCTCCGTCCCATTTT miRNA* TATGGGACAGTGGGAGTATTT mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAGATCATTTAACAAAATTTTCTACTCCCTCCGTCCCATTTTATGTGGCAACCTTTCCTTTTTAGTCCGTCCCAAAAAGAATGTTATCTTACTATAATTA
GCAACAATTTAACTTTAAAATACCCATTTTACCTTTAATGAAATGATTTTCAACCACACAAATATCTAAGAATTGTTTTAGACCACAAGTTCCAAAATTC
TTCCTTTTTTTCTTAAACACCGTGTCAAGTCAAATGGTGCCACAAAATATGGGACAGTGGGAGTATTTGTTGTTCTTTGCAAGTTG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR812h: 0.0002 PMRD osa-miR812h: 0.0002 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.00002 | most similar mature miRNAs |
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