ABOUT THIS RECORDspecies: Vigna unguiculata
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Vigna unguiculata Vigna Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCATCGTCATCATCATCATCA miRNA* ATGCGGGTGGTGGCGGTGGGG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
AATCACAAAATAATCATCATAATCATGAATACCATCGTCATCATCATCATCATCAACAGCCAACCCTCCCAGATATCGAATCAACAAACACATCAACGAC
GAACAAAGCTAGAGAAAACACATAAAACCCGGAAAAGAGAAAGAGAAAAAGAAAACGCTACTCAACAAGACCAGAGGATAAAATAAATGAAATAGATCCC
GTCCGTCCGTCGGTGAAAAACAAGATCAAGGGCCGAAGAGCCTCCACGTGGACGAATCCCGACCGTCAGGTCTGTTTTCAAGCCAAGAGCATGGCGACCA
AGGTTCCCGCGATAGCAGAGCCAGCAACGAAGGACTTGGAAACGGAGAATGCGGCGTTGGGTGGTGGGGGTGAATCGCTGCCACCTGAGGGTGGAGATGC
GGGGGCGTCGCTGGATGGTGGTGCTGGTGGAGAGTCAGAAGGATTAGAAGACGGACCGGGAGCTCCAGCAGGTGGAGTAGTAGAAGCTGGGGCAGGAGCG
GGGACAGGTGCTGGTGGTGGAGTTGCTGGTGTGGGTGCGGGTGTAGGTGTTGCTGCAGATGGTGGTGGAGTTGCTGGTGTGGTGGGTGTAGGAGCCGGTG
CCGATGCGGGTGGTGGCGGTGGGGTGGTTGTGGGAGGCTGTGTAGGTGCACC
dot-bracket secondary structure
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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