ABOUT THIS RECORDspecies: Paracentrotus lividus
miRNA family: miR-3664
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Paracentrotus lividus Paracentrotus Echinidae Echinoida Echinacea Euechinoidea Echinoidea Echinozoa Eleutherozoa Echinodermata Deuterostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AACTCAGTCTTCACTCAAGAA miRNA* CTGGACCGAAGACTGTGTTTG mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTAACCCGTATTCTGGACCGAAGACTGTGTTTGTGATAGTTGAAGTTTGTGCAAAGCTGTTGTATGATCCTTTTGTCTGATGCATTAGTCAACATCAGAC
GAAAGGATTGCACAATGGCTTTGCACAGGCTTCAACTAGTACAAACTCAGTCTTCACTCAAGAATATGGGCCA
dot-bracket secondary structure
....((((((((((.((..((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((..........))))))))
)))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))))))..)).))))))))))...
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
TTAACCCGTATTCTGGACCGAAGACTGTGTTTGTGATAGTTGAAGTTTGTGCAAAGCTGTTGTATGATCCTTTTGTCTGATGCATTAGTCAACATCAGAC
GAAAGGATTGCACAATGGCTTTGCACAGGCTTCAACTAGTACAAACTCAGTCTTCACTCAAGAATATGGGCCA
dot-bracket secondary structure
....((((((((((.((..((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((..........))))))))
)))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))))))..)).))))))))))...
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
