ABOUT THIS RECORDspecies: Medicago truncatula
miRNA family: MIRf469
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Medicago truncatula Medicago Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCTGTAATCCCAACACTTTGG miRNA* AAAGTGCTGGGATTATAGGTC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
ACTAATTATTTTTGTAGAGATAGGATNTCACTGTGTTGCCCGGGCTGGTCTCAAACTTCTGGCCTCTAGTGATCCTCCCGCTTTGGACTCCCAAAGTGCT
GGGATTATAGGTCTGAGCCACCATGCCCAGTCAGCGTTTATCANATTACTTACCATCACTACTTTGTCCTGGGGAAATCCTCTTAATCCTTAAAGGNGCA
ATCCAAAATCATAATGTTCCCGTGTTACTTACTGTTACTTTTTTTTTTTCTCCTATAGTGGTTTGATGATAAGAACCCAATTTGGGCCGGGCGCGGTTGC
TCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTAAGCCAGATGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTTGAGACCATCCTGACCAACATAAAGAAGTCCTATCTC
TACTAAAGACACAAA
dot-bracket secondary structure
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ACTAATTATTTTTGTAGAGATAGGATNTCACTGTGTTGCCCGGGCTGGTCTCAAACTTCTGGCCTCTAGTGATCCTCCCGCTTTGGACTCCCAAAGTGCT
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TACTAAAGACACAAA
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SIMILARITIES| miRBase hsa-mir-5096: 0.00000000000002 PMRD ptc-miRf12412-akr: 0.000000000006 microPC no hits | UniProt sp|Q8N2A0|CX062_HUMAN: 0.00000001 RFAM Metazoa_SRP: 6e-31 | most similar mature miRNAs |
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