miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008451
species: Sorghum bicolor
miRNA family: MIR812
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTGAATAAGACGAGTGGTCAA

miRNA*
 GACCACTCGTCTTATTCAAAG

mismatches: 0
bulges: 0
View larger
pre-miRNA
 CCATGTACCATAATAGGGTACTCAATCCATCCCAAATTGTAAGTCGTTTGACTTTTTTAATATCAAGTTTGACCACTCGTCTTATTCAAAGTTTTGTATA
AAATATCACTTTTTTTTTGTTGTGTATTGGTTTATTAATAAAAGTTCTTCAAGAATAACTTAAATTTGACTATATTTGCACAAATTTTTTGAATAAGACG
AGTGGTCAAACTTGGTGTAAAAAAAGTCAAACGACTTACAATTTGGGATGGAGGGAGTACTACTGTACCATCTTTTTT

dot-bracket secondary structure
............(((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((...
((((((.......(((..(((((...((((...(((......)))...))))..)))))..))).......))))))..)))))..))))))))))))))
)))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))).))))............


SIMILARITIES
miRBase osa-MIR818e: 0.00000000002

PMRD osa-miRf10207-akr: 0.00000000002

microPC miR806: 0.0000002		UniProt no hits

RFAM MIR806: 7e-79		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record




Liczniki na strone;