ABOUT THIS RECORDspecies: Sorghum bicolor
miRNA family: MIR2504
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGACCAAGTTTATAGAAAAT miRNA* TTTTCTACAAACTTGGTTAAAG mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
AAAGTTTTTATACTCCCCAATTCCAAAATGTTGGTTGTTTTAGTTTTTGTCATAAGTAAATTCTCTCCAACTTTGACCAAGTTTATAGAAAATACACCAA
CATGGCAACATCTACAAAATGAAATGAATTTCGTAAAATCTATTTTGAATATTCTTGATAGTGCAATTATTTGGTATTGCTGATGTTAGTATATTTTTCT
ACAAACTTGGTTAAAGTTAGAGAAGTTTGACTTATGATAAAACCAAAACGACCTACATTTTGGAGTGGATGGAGTACAAAATAGA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR437n: 2e-100 PMRD sbi-miR437n: 2e-100 microPC miR437: 3e-99 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
Identical with: sbi-miR437n from PMRD (MNEST054510) |
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