ABOUT THIS RECORDspecies: Sorghum bicolor
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTAGGCTTAAAAGATTCGTCT miRNA* ACAAATTTATTAAGCATAATT mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGCATGCTTGGCCTGTTTAGATTGGGGCTGAAAATTTTTTGGGTGTCACATCGAATGTGTGGGAAGGATGTCGGGAGGGATTTTTAGAAACTAATAAAAA
AATAAATTACATAGCTCGTCAGGAAACTGCAAGACAAATTTATTAAGCATAATTAATCTGTCATTAGCATATGTGGGTTACTGTAGCACTTAAGGCTAAT
CATGGAGTAACTAGGCTTAAAAGATTCGTCTCGCGATTCTCAACTAAACTGTGTAATTAGTTTATTTTTTTATCTACATTTAATGTTCCATGCATGTGTC
CAAAGATTCGATGGGATGGATGAAAAAATTTTTGGTGGGGAACTAAACAGGGCCTAAGAAT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR2124a: 0.0000000000003 PMRD osa-miRf10806-akr: 1e-21 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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