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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008646
species: Brassica oleracea
miRNA family: MIR1885
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Brassica oleracea Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 CATCAATGAAAGGTATGATTCC

miRNA*
 AATCACACTTTCATTGATAAT

mismatches: 3
bulges: 1
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pre-miRNA
 NAAAATCTTCTTCTGTATTTTCTTCTNNNGACTTCCTTCTTCTTTGTCNNNAACTGTCTCCATCCTGTCTTCACGAGCTTCCTCTAGAAGATGTGCGCAG
AGTCTTTCTAAGTCACACTCATAAAGAGTTCAAAGAAAAGGAATCACACTTTCATTGATAATGAAATCAATAGAGAATGCTACTGAGCTCCTACAGGCGA
TTAGAAAATCTAATATGGCGATAGTCTTGCTCTCTATGAAGTGTCTATGAGAACAAGATTATCGCGATCTTAGATCCTCTAATTGCTTGTAAGAGCTGAT
CACCAATGGATCATTCGCTATTGATCTCTTCATCAATGAAAGGTATGATTCCCTTTCTTTGAAATTCCTTTTGAATGTGACTGAGAAAGCTTCTATGTAC
ATCTTCTCCGCGGAAGCTCATGAAAACAAGGTAGAACCAATTGTGGACAAAGAAGGAAGACATGAAAAAGATAGAGAAGAAGATCAACTT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase bra-MIR1885: 1e-68

PMRD bra-miR1885: 1e-68

microPC no hits		UniProt sp|O82500|Y4117_ARATH: 0.0000000000003

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
Source sequences
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