ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica oleracea
miRNA family: MIR824
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brassica oleracea Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAGACCATTTGTGAGAAGGGA miRNA* CCTTCTCATCGATGGTCTAGA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
CCTCGAGTTGTCTTTCATGTCTAGACCATTTGTGAGAAGGGATTTTTTGTTTGCACCGTTCACCCCACTTTCAATCTGTAGTGAGTATTAAGGAAAATAG
CTTGTTCAACATATCACACTACTCTTTTAGAAACAATACTATATTTTAGATGCTTTTCCAGCTTGATATACGTTGTTTTGTTATGTATATCTGTATTATC
CCGGCTACCAAAACGTTAAGAAATAAGGTGAACATCCTAAAACCTGCATCCAATTAGAAAGGTCTAGGTCACAGATATTACTTGTTATCTCTTGATTAAG
CTATTTTATTTCTATCAGCATGATCAGATCATTCAGGAGTTAAGTATAAACTAAAATACATTAAGTCCATTCATGACATTTCTGGATGCTGCATACATAA
TATTTTCCTTGTTTTTGGACTATGCCACACTTCGGACAGACATTTTGCCTAAGAGATGTCAAACCTCTGTCTGGAGTGTTAGAGGTATTTCATGATAGCT
AAGAACTTGAATCTTGCACTACTTAGCTACACTAGATTACTTCATAGTAAATAACTTGGGGAGTGGGGGAAGGTGCTGGGTTATTATTCCCTTCTCATCG
ATGGTCTAGATGTGCGAGGTGACACTCA
dot-bracket secondary structure
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD bol-miR824: 0 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR824: 0 | most similar mature miRNAs |
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