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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST008840
species:
Populus trichocarpa
miRNA family:
MIRf1281
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Populus trichocarpa
Populus
Saliceae
Salicaceae
Malpighiales
fabids
rosids
core eudicotyledons
eudicotyledons
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
GGTGTTTGGTTGATGAGAAAG
miRNA*
TTTTTGTTAATTATATAAGAT
mismatches:
3
bulges:
0
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pre-miRNA
TTTTTTTTTTTTT
TTTTTGTTAATTATATAAGAT
TATGGCACTGAAGTATCATATCTCAGATGCACTATCACATCCCACTTTCAGAATCACACAGAAACC
AAATTGAACAACAGATGTTTCTGTTTCTTTTACCTTTGACATCATCATGCTATCAGTTAGGCATGCTGCTCAGGCTAATATTAACATGTAAGAATACAAT
CATCCTTTGTCAGATGGAAGCTGCACTGAGAGATCCACCCAGTTGCTCTAATCATCTAGCAAAGCACCCATCGTCCATTCATAGCATGATGGTGTAGCTC
ATTCATCACCCACGCATAGAACGAATATGTTCCCATTTCAGAAGGATGCGCTGACTTCTTTGTTTGCTTTCTCAAGTGCAAACTGGTAGTGTTAATGCCT
CTCTCTCTCTTCATCTGTCAGCACTATGTCTTCAGGTGCCATGAACTAAGAGATTAGCATAGCAATTCTGAGAAACCAAGCCAGTGGCATTGAACTGGTA
AATAAGGCGGTTCCATAAGGGCAGAGTGGGAACAATATGGTGAGTTCTTATCATGTCATAGAAAGTGTCTGTTGCTTTGGAAAGTCTGCCACAAGTCAAA
TAAAGGTGTATAAGAGTGCAGAAAAAAGAAGCATAAAGATGGGTTTTAGTTGGTGAGATGGAATTTGTGTGAAAATGGTGAAAAGGAAGGATTTTTGAGA
GAGGTTTTG
GGTGTTTGGTTGATGAGAAAG
TGAAAGATCT
dot-bracket secondary structure
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sp|Q9LER0|PP381_ARATH: 0.00000008
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