ABOUT THIS RECORDspecies: Populus trichocarpa
miRNA family: MIRf1281
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Populus trichocarpa Populus Saliceae Salicaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGTGTTTGGTTGATGAGAAAG miRNA* TTTTTGTTAATTATATAAGAT mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAATTATATAAGATTATGGCACTGAAGTATCATATCTCAGATGCACTATCACATCCCACTTTCAGAATCACACAGAAACC
AAATTGAACAACAGATGTTTCTGTTTCTTTTACCTTTGACATCATCATGCTATCAGTTAGGCATGCTGCTCAGGCTAATATTAACATGTAAGAATACAAT
CATCCTTTGTCAGATGGAAGCTGCACTGAGAGATCCACCCAGTTGCTCTAATCATCTAGCAAAGCACCCATCGTCCATTCATAGCATGATGGTGTAGCTC
ATTCATCACCCACGCATAGAACGAATATGTTCCCATTTCAGAAGGATGCGCTGACTTCTTTGTTTGCTTTCTCAAGTGCAAACTGGTAGTGTTAATGCCT
CTCTCTCTCTTCATCTGTCAGCACTATGTCTTCAGGTGCCATGAACTAAGAGATTAGCATAGCAATTCTGAGAAACCAAGCCAGTGGCATTGAACTGGTA
AATAAGGCGGTTCCATAAGGGCAGAGTGGGAACAATATGGTGAGTTCTTATCATGTCATAGAAAGTGTCTGTTGCTTTGGAAAGTCTGCCACAAGTCAAA
TAAAGGTGTATAAGAGTGCAGAAAAAAGAAGCATAAAGATGGGTTTTAGTTGGTGAGATGGAATTTGTGTGAAAATGGTGAAAAGGAAGGATTTTTGAGA
GAGGTTTTGGGTGTTTGGTTGATGAGAAAGTGAAAGATCT
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|Q9LER0|PP381_ARATH: 0.00000008 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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