ABOUT THIS RECORDspecies: Populus trichocarpa
miRNA family: MIRf37
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Populus trichocarpa Populus Saliceae Salicaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTCGGTTCGGTTCGGTTTTT miRNA* AAACCGAAACCGAACCGGCCGA mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
GTAAAGAGTAGGGGTGATCATTTTCGGTTCGGTTCGGTTTTTATCAAAAAAAGTAACCAAACCGAAATTTTTTTTTGAAAAAAAAAACCGAAACCGGTTC
AAACCGGTTTGGCTCGGTTTTTTCGGTTTGGCTTGGTTTTTCTGGTTTGGCTCGGTTTTTTTTCTGGTTTTGTTTTGTTTCGGTTTGGTTCGGTTTTTTT
GGTTTTTTTGCTTATAAAACCGAAACCGAACCGGCCGATTTTTTCAAAATTTTAAT
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ptc-miRf10360-akr: 1e-18 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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