ABOUT THIS RECORDspecies: Phaseolus vulgaris
miRNA family: MIR319
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Phaseolus vulgaris Phaseolus Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT miRNA* GGAGCTTCCCTCAGCCCATTC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAGAGAGTGAAGGAGCTTCCCTCAGCCCATTCATGGATACAAAAGATTGGGTTGCAAAATTAACCACTAACTCATTCACACAATAGTATTCAGTTAGGGTG
ATGCTCTTTTTGCTATAATATGATTGTGTGAATGAAGTGATGCATACATATTGTGTGACCCTCTTTCTCTGAGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTTCTTTC
TG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase pvu-MIR319c: 2.0E-112 PMRD pvu-miR319c: 2.0E-112 microPC miR319: 1.0E-103 | UniProt no hits RFAM 9MIR159: 3.0E-12 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST046580), pvu-MIR319c from miRBase , pvu-miR319c from PMRD |
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