ABOUT THIS RECORDspecies: Ricinus communis
miRNA family: MIR2673
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Ricinus communis Ricinus Acalypheae Acalyphoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ACTCTTCCTCTTCCTCTGCTG miRNA* ACAGGGAAAAGGGAGAGACC mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
GTTCACACAATAACAGGGAAAAGGGAGAGACCAGTAGAGAAGACCACCTGATTCAACTACTCCTCCCTCCTAACTTCACCGAACTCACTCCTCTATCCAT
GGCTTTTCTTTTTCTGCTATTTTCTTCTTTATTCCTCATTTAGCTCAATTCAGTCTCTTCCTGTTCCACCTTAAAAAATAAAAAAGCATCATAAAGAAAA
AGATTTATAATTTTGACTACCCTTTCTCACTAGTTAATTAAATGGCAGATGTTGCTCGATTAATATCTTCTCACTCTCTTCGTTTCTCTTCTTCTCTCAT
CACCGTCAACGTTAATTCCCTCCCTCCTAATAACTATTACTATTCAGATAAGAAGATTTACCCTTTAATTTACTCTTCCTCTTCCTCTGCTGCTAGTGTT
C
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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GGCTTTTCTTTTTCTGCTATTTTCTTCTTTATTCCTCATTTAGCTCAATTCAGTCTCTTCCTGTTCCACCTTAAAAAATAAAAAAGCATCATAAAGAAAA
AGATTTATAATTTTGACTACCCTTTCTCACTAGTTAATTAAATGGCAGATGTTGCTCGATTAATATCTTCTCACTCTCTTCGTTTCTCTTCTTCTCTCAT
CACCGTCAACGTTAATTCCCTCCCTCCTAATAACTATTACTATTCAGATAAGAAGATTTACCCTTTAATTTACTCTTCCTCTTCCTCTGCTGCTAGTGTT
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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