ABOUT THIS RECORDspecies: Taenia solium
miRNA family: miR-1701
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Taenia solium Taenia Taeniidae Cyclophyllidea Eucestoda Cestoda Platyhelminthes Acoelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGCTGGTTGGTTGGTTGGTTG miRNA* ACTGGCCGCCCTGCTTGCCTA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GATCCAGCTACACGTGCGCCTCGGTGGGTTGGCGAGGAGGTGGGTGGATGATCAGTTGGTTGGCTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGCTGCCTGCT
GACTGGCCGCCCTGCTTGCCTACTAGCTTGTCCATTCGCCCGCCCTGCCTTGTGCTTCTGTCGTCGAGGAGTGCTTGTCT
dot-bracket secondary structure
.........(((.((((.((((((((((...((((((.((((((((((((((.(((((((.(((.(((.((.((((((((((((.(((.....))).)))
))))))))).)).))).))).))))))).)).))))))))))))...))))))...))))...)))))).)))).)))..
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
GATCCAGCTACACGTGCGCCTCGGTGGGTTGGCGAGGAGGTGGGTGGATGATCAGTTGGTTGGCTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGCTGCCTGCT
GACTGGCCGCCCTGCTTGCCTACTAGCTTGTCCATTCGCCCGCCCTGCCTTGTGCTTCTGTCGTCGAGGAGTGCTTGTCT
dot-bracket secondary structure
.........(((.((((.((((((((((...((((((.((((((((((((((.(((((((.(((.(((.((.((((((((((((.(((.....))).)))
))))))))).)).))).))).))))))).)).))))))))))))...))))))...))))...)))))).)))).)))..
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
